众所周知，企业财务分析指标的数据来源于会计报表和会计资料，而会计报表是反映企业一定时期经营成果及一定时点财务状况的书面文件。对中小企业来说，财务报表反映的数据在某种程度上存在着一定的局限性，必将造成财务分析指标的不足和局限。

 1．报表信息并未全面反映企业可以利用的经济资源。企业列入报表的数据资料仅是可以用货币计量的经济资源。实际上企业有许多经济资源受客观条件制约或是受会计惯例的制约并未在报表中得以全面体现，报表仅仅反映了企业经济资源的一部分。企业财务指标分析受此影响，分析反映的结果必然存在一定的局限性和不足。

 2．企业会计政策在运用上如前后有差异，就会使企业自身历史与现在的对比、企业与企业之间的对比失去实际意义。如果企业在执行会计政策上与以往不同，在不同会计年度采用不同会计方法，那么不同企业在不同会计方法下形成的财务分析信息就存在不可比性，就会造成企业自身历史与现在、与同行业企业之间财务分析指标失去实际意义。